Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD54BQ9Y620 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms