Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP1Q9Y3L3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SH3BP1Q9Y3L3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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