Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms