Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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