Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
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USP35Q9P2H5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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