Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms