Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms