Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms