Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPATA16Q9BXB7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA16Q9BXB7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms