Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAGR1Q9BTK6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAGR1Q9BTK6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAGR1Q9BTK6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAGR1Q9BTK6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PAGR1Q9BTK6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PAGR1Q9BTK6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PAGR1Q9BTK6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAGR1Q9BTK6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms