Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TAF4BQ92750 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms