Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HDDC3Q8N4P3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HDDC3Q8N4P3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDDC3Q8N4P3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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HDDC3Q8N4P3 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDDC3Q8N4P3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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