Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RPE65Q16518 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RPE65Q16518 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RPE65Q16518 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RPE65Q16518 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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