Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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