Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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