Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE3BQ13370 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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