Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms