Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms