Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNA1Q09470 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms