Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CENPEQ02224 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.9 ms