Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms