Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDST1P52848 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDST1P52848 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDST1P52848 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDST1P52848 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDST1P52848 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDST1P52848 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms