Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS1P48651 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS1P48651 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS1P48651 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTDSS1P48651 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1P48651 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 855.7 ms