Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACADSBP45954 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms