Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBTFP17480 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms