Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms