Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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