Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPO2Q9UMS6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms