Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HCN3Q9P1Z3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms