Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms