Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM48Q8IWZ4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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