Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms