Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.6 ms