Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms