Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms