Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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