Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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NDUFA9Q16795 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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NDUFA9Q16795 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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NDUFA9Q16795 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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NDUFA9Q16795 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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NDUFA9Q16795 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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NDUFA9Q16795 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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NDUFA9Q16795 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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