Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK5Q16478 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms