Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RAB35Q15286 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RAB35Q15286 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RAB35Q15286 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RAB35Q15286 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RAB35Q15286 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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RAB35Q15286 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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