Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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