Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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