Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms