Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP4P49662 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP4P49662 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms