Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NESP48681 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NESP48681 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NESP48681 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NESP48681 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms