Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOX11P35716 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SOX11P35716 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SOX11P35716 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SOX11P35716 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SOX11P35716 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOX11P35716 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SOX11P35716 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOX11P35716 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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