Protein–RNA interactions for Protein: P30533

LRPAP1, Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPAP1P30533 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRPAP1P30533 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms