Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRFP10586 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms