Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC105415.1-201ENST00000509015 1416 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 BIN2P2-201ENST00000503900 1303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC008514.2-201ENST00000522096 1337 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC005736.1-201ENST00000576810 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AL449266.1-201ENST00000357393 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 KCNE1-205ENST00000416357 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 KIF9-204ENST00000425853 740 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ZNF195-208ENST00000438262 1018 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 OTX2-206ENST00000555006 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC011477.4-201ENST00000590274 609 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SPCS1-205ENST00000602728 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms