Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

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Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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NPIPB13A6NJU9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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NPIPB13A6NJU9 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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NPIPB13A6NJU9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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NPIPB13A6NJU9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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NPIPB13A6NJU9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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NPIPB13A6NJU9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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NPIPB13A6NJU9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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NPIPB13A6NJU9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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