Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 369.8 ms